Конфиг www pool найдите
http://img13.imageshost.ru/img/2012/09/07/image_504a025fea516.jpg
Обычно он должен быть в /etc/php5/fpm/pool.d - есть такая папка у вас?
Конфиг(оперативка, процессор) сервера у вас какой?
И выложите весь конфиг www pool`a
/etc/php5/fpm/pool.d/www.conf - тут должен быть.
И еще напишите вывод top
Оптимальные значения для себя выставите.
http://php.net/manual/ru/install.fpm.configuration.php
В конфиге php-fpm посмотрите куда он логи пишет. Конфиги тут /etc/php5/php-fpm
"Общие" логи nginx /var/log/nginx - здесь
Как вы поняли, что php-fpm у вас перезагружается? Скорее всего все процессы заняты. Без логов могу только предложить увеличить кол-во процессов php-fpm, последить за нагрузкой(например через htop).
ОС какая?
centos
debian
А вообще посмотрите на репозиториях должна быть java, но не послед версии.
если у вас ispmanager то
/etc/nginx/nginx.cong - все виртхосты в этот файл пишет.
Из конфига виртхоста убрать
А вообще, что-то странное вам написала тех поддержка.
Посмотрите у вас мб настройки апача прописываются у вас в /etc/httpd/conf.d/swtune.conf
А я 30 минут например.
Nginx используйте и проксируйте запросы к apache.