Дубль главной? или нет

У вас 301-й редирект стоит, поэтому дубля нет. Просто где-то ссылка стоит на http://alcocopy.club/index.html - надо её найти и исправить на http://alcocopy.club

посмотрел дальше в xenu и обнаружил что все страницы есть без html и с html

я думаю это htaccess виноват

Options +FollowSymLinks

RewriteEngine On

RewriteCond %{HTTP_HOST} ^www.alcocopy.club$ [NC]

RewriteRule ^(.*)$ http://alcocopy.club/$1 [R=301,L]

RewriteCond %{THE_REQUEST} ^[A-Z]{3,9}\ /index\.html\ HTTP/

RewriteRule ^index\.html$ http://alcocopy.club/ [R=301,L]

RewriteEngine onRewriteBase /

RewriteCond %{THE_REQUEST} ^[A-Z]{3,9}\ /index\.html\ HTTP/

RewriteRule ^index\.html$ http://alcocopy.club/ [R=301,L]

RewriteCond %{THE_REQUEST} ^[A-Z]{3,9}\ /([^.]+)\.html\ HTTP

RewriteRule ^([^.]+)\.html$ http://alcocopy.club/$1 [R=301,L]

RewriteCond %{REQUEST_URI} !(\.[^./]+)$

RewriteCond %{REQUEST_fileNAME} !-d

RewriteCond %{REQUEST_fileNAME} !-f

RewriteRule (.*) /$1.html [L]

<ifmodule mod_deflate="" c="">

SetOutputFilter DEFLATE

Header append Vary User-Agent

</ifmodule>

подскажите что не правильно или как исправить

Да причем тут htaccess - у вас в меню ссылки с html, вот их надо везде поменять на ссылки без html и все.

goodov, все у вас нормально, вы просто отчетов xenu не понимаете. С www редиректит на без, с index.html на морду.

p.s. все нормально, кроме содержимого сайта. Я бы за такое убивал, медленно и мучительно.