Переход на https, проблема с доменом

Всем привет!(нужен совет опытного гуру) Вот такая проблема:

Подключили https, но браузер выдает предупреждение о небезопасном подключении

Проблема с доменом

Сертификат зарегистрирован на site.ua, а на хостинге домен вбит site.соm.ua, site.ua настроен как алиас. Из за этого браузеры ругаются : site.com.ua использует недействительный сертификат безопасности. Сертификат действителен только для следующих имён: www.site.ua, site.ua

проверку сертификата при этом проходит

Обратился в тех поддержку, ответ:

Для того, чтоб все корректно работало, основным должен быть домен для которого активирован сертификат. Поэтому, для того, чтоб ошибок не было, нужно отключить оба домена от хостинга и подключить домен site.ua в качестве основного, а site.com.ua как синоним. Учтите, чтоб при выполнении этой операции, если у Вас созданы почтовые ящики, они будут удалены со всем содержимым.

Что нужно сделать:

Сделать бекап сайта,бызы.

Удалить домен com.ua,

Создать домен уа

Создать алиас ком.уа.

Если удятся файлы, база - восстановить с бекапа

прикрутить сертификат.

Внимание вопрос...Отразится ли это негативно на SEO и как можно избежать проблем???