Закрывать ссылки от индексации или нет?

да, стоит.

Sergh545, вы никак не скроете от гугла ссылки - ни джаваскриптом, ни аджаксом. Вы можете запретить их индексацию, если запретить в роботс.тхт джаваскрипт, их генерирующий, но в этом случае гугл в вебмастере будет грозить понижением сайта в выдаче, да и всё равно будет их видеть, хоть и без включения в индекс.

Или речь лишь о nofollow?

Закрытие ссылок от индексации в nofollow никак не сказывается негативно на пользователе, но говорит, с высокой вероятностью, что ссылка не продажная. Закрывайте, если нет иного договора с организациями-акцепторами.

А редирект php?

не рассказывайте сказки - у гугла, как и у яндекса, достаточно примитивный алгоритм

и ни чем они не грозят

Актуальность закрытия ссылок уходит уже на второстепенный план. Я бы не закрывал.

Давайте уточним, о чем речь. Я не о nofollow, а об индексации текста анкора ссылки. Я пробовал ссылку публиковать разными способами, включая джаваскрипт и аджакс. Так вот если файл джава скрипта, который публикует ссылку не закрывать к индексации в роботс.тхт, то гугл включает текст ссылки в индекс. Если же файл джаваскрипта запретить к индексации, то в вебмастере появляется предупреждение о возможном понижении сайта в выдаче из-за наличия заблокированных ресурсов. Мне что, не верить глазам своим? Хотя, конечно, вряд ли по такой мелочи будет пессимизация.

Я хотел не афишировать афиллированность двух сайтов, связанных сквозной сылкой, но понял, что это не возможно ни скрытием ссылок, ни редиректом (он в индексе с редиректом связывает целевую страницу). В итоге я плюнул на эту затею. В любом случае в конце концов он видит и отслеживает реальные переходы.

ЗЫ

Это всё касается если ссылку публиковать джаваскриптом по событию onload. Если же по какому то другому событию публиковать ссылку, то тогда гугл не будет ее индексировать. Но повторюсь, что гугл по любому видит реальные переходы и поэтому я отказался от затеи скрыть это дело.

лучше закрыть тегом nofollow.

не нужно. Это же карточка фирмы, а ней и ссылка на сайт. Выглядеть будет как до стоимость.

значит проблема не в этом, а в чём-то другом ;)