Дублируещее меню. Насколько критично к закрытию к индексации?

Я не вижу внятных причин заморачиваться и закрывать дублирующее меню от индексации.

Что сейчас, что раньше :).

Почитайте информацию относительно тега Canonical. Если указать первоисточник меню то остальные дубли уже не будут восприниматся дублями.

Не очень понимаю. Покажите пример того, как указать первоисточник меню?

также не вижу причин для закрытия меню, если оно принесет пользу посетителям, сделав навигацию более удобной (то есть будут переходы через дублирующее меню)

Если вторым меню пользуются, то есть оно несёт какую-то ценность, то пусть будет открыто.

Актуально раскрыться для пользователя.