Интернет-магазин в 10 городах: использовать ли домены третьего уровня?

1. Первый вариант самый дорогой, но и самый удобный в плане администрирования и работы с пользователями. Контент на на поддоменах должен быть достаточно уникальным, чтобы поисковик посчитал их за разные сайты. Дублей не будет, если контент на страница для разных городов будет различаться.

2. "либо клиенты из 10 городов будут попадать с поиска на все товары, большинство из которых только в Москве и МО" у большинства магазинов, где реализована такая схема, работает именно так, к сожалению. заходишь из поиска по названия товара и видишь, что в твоем городе он недоступен.

3. Вот в этом варианте вам как раз проблемы с дубликатами не избежать.

Вопрос простой, никак, оставить структуру каталога так, как есть сейчас, тоесть единной для всех городов. Если покупатель выбирает конкретный город, светить ему наличие именно этого города + у Вас же должна быть доставка с МСК в те города, значит писать, что есть в наличие на складе, доставка 2-7 дней, если нет в том городе.

Яндексу ненужно понимать, есть в наличие товары или нет, тут важна регионльная выдача, а с ней Вы разберетесь...

+ Вам нужно проанализировать рынок и понять, что есть на складах у конкурентов, будут ли люди ждать товар с МСК или купят его там где он есть в наличие в их городе. И еще фишка, Вы будете давить ассортиментом, тк у регионалов не будет столько товаров на складе, как у вас в МСК. И люди будут готовы ждать то, что они хотят...