Новая версия сайта на другом домене - реально ли сохранить какие-то позиции.

Это вопрос явно не по веб-строительству, вам бы в раздел по поисковикам сходить.

Имхо, кроме общего редиректа со старого домена на новый вы тут все равно ничего сделать не можете, раз урлы разные, движок разный и тд.

Уточню, не только с морды сайта на морду, а полностью со всех страниц сайта в морду нового. Ну или хоть при минимальной возможности частичных редиректов в такие же страницы - заморочиться и проставить.

а через хтакесс прописать все редиректы руками?

делаем карту сайта с тайтлами на одном движке, на другом движке. Сортируем по алфавиту тайтлы, чтобы урлы совпадали, потом копируем урлы с первой карты сайта в один столбик в экселе, со второй карты сайта - в другой столбик. Дописываем в нужных местах команды редиректа 301 и все это вставляем в файлик хтакесс. Да, он будет громадных размеров, но вероятность передачи позиций довольно высока.

т.е. по сути много постраничных 301 редиректов? попробовал в этом случае редирект работает, но к url нового сайта добавляется префикс, который попадёт в индекс и станет дублем. видимо, какие-то нестыковки серверных настроек cms.

если не сохранить структуру сайта, скорее всего все обвалится, если новый домен то 301 редирект в htaccess, по маске все разделы переадресовывать на новый сайт

поспрашивайте с теме битрикса (это ж новый двиг) как по умному настроить кучу редиректов, чтобы не было никаких префиксов и тому подобное. Существует множество извращенных способов, я лишь указал общее направление для мысли и показал, что даже чисто "ручной" редирект 301 можно автоматизировать и сделать довольно быстро, раз не получается масками.