Настройка apache и htacess

http://httpd.apache.org/docs/2.2/ru/vhosts/name-based.html

Средствами .htaccess - никак. Вы используете не тот инструмент, которым решают подобные задачи.

Сделайте несколько виртуальных хостов, для каждого укажите свой DocumentRoot.

...../wwwroot/domain1/www

...../wwwroot/domain2/www

...../wwwroot/domain3/www

Правильно делать через виртуальные хосты, как уже сказали.

Если доступа к основному конфигу нету, то можно так:

RewriteEngine on
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^a.ru$
RewriteCond %{REQUEST_URI} !a.ru/
RewriteRule (.*) /a.ru/$1 [L]