Это фильтр или что?

Почитайте о supplemental results

так это получается что из 6 900 в выдаче гугла сидят только 699 страниц?

Это означает только то, что страницы в "соплях" малозначимы, дулированны, перспасмлены и т.д. И с ними нужно работать.

теперь понял, и обнаружил, что из за ошибки движка создавались 2 разных url на 1 и тот же материал, и уже решил проблему с дублями с помощью тега rel=canonical. После данного действия с ликвидацией дублей, через сколько времени страницы вылезут из соплей?

Зависит от того как часто ваш сайт индексируют.

поскольку сопли малоинформативны, ПС заходят на них гораздо реже.

Попробуйте потвитить эти странички, попиарить в соц.сетях.

В общем постарайтесь привлечь робота на эти страницы.

С 2007 года таким образом (добавление /&) не проверяют "сопли" в гугл. Ничего ровным счётом это не значит.

Почитайте тут.