решил сменить адреса страниц,как правильно сделать?

Сделайте 301й редирект со старой на новую

А то что я сделал это не 301 редирект?

и если нет то как его сделать?

Видимо наоборот?

http://devaka.ru/articles/redirect-301

т.е. надо прописать в .htaccess для каждой страницы:

Redirect 301 /photo/show.html http://сайт.ru/photo.html

У меня это прописанно в роуте.

Т.е контроллер называется photo,а функция внутри show

И теперь при обращении к /photo у меня автоматически загружается функция show.

Т.е адресная строка теперь просто как www.site/photo НО!!!!

в индексе яндекса уже записан адрес www.site/photo/show

Я бы хотел чтобы яндекс поменял его(поменял у себя там в базе на www.site/photo)

Но я боюсь что он посчитает это за 2 разные страницы(и www.site/photo примет за дубликат)

Как быть в данной ситуации?

Xoma_204, http://help.yandex.ru/webmaster/recommendations/changing-site-structure.xml

Т.е я правильно понял яндекс увидим на моем сайте новую ссылку www.site/photo (вместо www.site/photo/show) возмет её и удалит старую www.site/photo/show?

Да, если вы правильно сделали редирект.

А что значит правильно?

То как я описал это правильно?(прописал в роуте чтобы при оброщении к одному адресу перенапрявлял ну другой)

Это уж вам виднее - правильно или нет, я же не вижу что вы там делали и как. Проверяйте.

В роуте прописал вот $route['photo'] = 'photo/show';

Правильно?это то же самое что и вы писали?