У кого нибудь было такое?

Глупый вопрос :)

Почитайте выше. Там я написал про 5 минутный пинг (мониторинг) каждого моего сайта. Если Метрика ругается, а остальные молчат, то тупо проверяю в ручную. Если это тянется хотя бы несколько дней (Метрика ругается, а остальные системы молчат, и Метрика ругается только на один сайт и ДДОСы не обнаружены и т.п., то я считаю, что тупит Метрика).

Если на одном сервере и на одинаковых скриптах находиться несколько сайтов, и один из них в день по нескольку раз сигнализирует, что он недоступен, а остальные нормально... то проблема либо в Метрике, либо в ДНС. Я сомневаюсь, что проблема в ДНС, а что Метрика может тупить - это я читал и у других пользователей.

Сайт полнюстью доступен и возвращает код 200 OK

Хостера тряси. IP роботов могут быть залочены.

Массово такое случилось совсем недавно, когда была атака на dle и wordpress сайты.

Значит реально недоступен для яндекса, мне ни по одному сайту просто так не шлет, наоборот, сайт явно не работает ,а метрика молчит. и после включения сайта бывает час-три молчит. А если уж пишет, то 100% доступа к сайту нет.

Когда случилась аналогичная проблема, реально ждал 3 апдейта пока сайт не вернулся в выдачу. Владелец сайта мягко говоря офигел от такого прикола на ровном месте. Потом сменили хостинг.

Вообще-то да. У аффтара сайт может открываться, а для яндекса быть недоступным.