Я.Метрика [вопрос]

vl273, можно, а чего нет.

Правда счетчик будет выдавать ошибку, что нет кода на главной. Как раз вчера такое наблюдал.

Но всякие вебвизоры должны работать.

Для чего Вам это нужно? Статистику можно смотреть для отдельных страниц, можно цели установить

На php элементарно сделать не заморачиваясь за 5 минут

Выводить код только на определённых страницах.

Вполне возможно с помощью php. Единственно проверка собственника всё равно в хеде должна остаться, иначе не будет вам инфу показывать.

Можно, но зачем прятать остальные страницы?

Возможно. Если есть необходимость.