После склеивания доменов позиции сайта накрылись тазом

Есть сайт который индексировался на домене 3 уровня, потом был куплен домен 2 уровня.

В общем сайту 5 месяцев и на домене 3 уровня он прекрасно индексировался и выходил в топ где не мешала конкуренция. На 4 месяц выдавал под 1000 хостов и 65% примерно было с яндекса. Раньше в яндексе он индексировался по 2м доменам сразу, но домен третьего уровня яша считал основным и весь трафик шёл по нему.

11 апреля домены склеились в яндексе и все позиции с доменом 3 уровня просто испарились. Прошло уже чуть больше месяца принципиально ничего не поменялось. Страницы по домену 2 уровня есть в поиске, но на таких местах где не светит солнце. Новые страницы так-же оказываются там.

Платоны прислали отписку, мол страницы в поиске там где надо. Ну а почему же раньше они были на нормальных позициях, а с нормальным доменом сидят в болоте?

Может была у кого нибудь подобная ситуация, что делать? Может быть сами выползут со временем?

PS:Просто руки опускаются после таких подарков от яши.