Массовый поиск и замена файлов в Freebsd

вы строку в скрипте

lst=`/bin/cat /home/files.txt`

заменили на

lst=`/home/files.txt`

верните обратно, и всё будет работать

alex@alex:~/test$ echo '.com" TARGET="_blank"' > 1.html

Замена делается так:

sed -i 's/old/new/' path

Экранировать надо прямой слеш, он служит разделителем для sed:

alex@alex:~/test$ sed -i 's/.com" TARGET="_blank"/.com\/er<? echo $ss2; ?>" TARGET="_blank"/' *.html

alex@alex:~/test$ cat 1.html 

.com/er<? echo $ss2; ?>" TARGET="_blank"

Добавить find по вкусу, если файлы в разных директориях.