Объединить или разъединить?

Нет единого решения:

Сайты могут быть немного разные, т.е. одна организация, одни контактные данные - но услуги и клиенты (аудитории) разные. Тогда подачу материалов бывает удобнее разделить на два сайта, ни сколько ради продвижения, сколько ради правильного управления коммуникацией (ну и с продвижением при таком подходе проблем обычно не бывает)) Это редкий довольно кейс, и здесь можно пойти по пути:

Если же ситуация классическая - есть два говносайта одной компании, у которых одна аудитория, одни и те же услуги, товары - тогда лучше их склеить по доменам и следить за контентом одного сайта, т.к. обычно сил и на это не хватает. Т.е. вариант:

Я перелинковал такие сайты. После результата аффилирования, когда один пропал и выдачи, после этого, вернулся.