Увеличить объём памяти для работы скрипта.

phpinfo показал

Configuration File (php.ini) Path /etc/php5/cgi

Поменял там лимит, перезагрузил сервер, один хрен та же ошибка с теми же цифрами.

Запустил фал-менеджер jsys.php, поставил архивацию папки с 20K страниц, и там та же самая ошибка с теми же цифрами.

Хрен поймёшь где он этот лимит берёт в 128М.

Sower, А после того как поменяли в phpinfo(); поменялся параметр memory_limit ?

Запусти скрипт с консоли, там можно указать путь к php.ini или выборочно задать значения параметров

Да, проверьте еще раз в phpinfo, изменился ли параметр. Плюс, конечно, маловероятно, но все же возможно, что значение явно указано где-то в .htaccess или даже в самом скрипте.

memory_limit можно задавать в самом скрипте через ini_set();

поищите в тексте скрипта, наверняка там где-то оно задано.