Страниц в поиске: 1

Скорее всего дело не в ссылках, хотя не знаю, что у вас там за "нетематические" ссылки были.

Думаю, дело в дублях страниц и в куче мусора, который вы в индекс запихали.

Вы совсем не любите файл robots.txt?

А смысл в использовании robots.txt тут? Какие страницы тут закрывать ?

Так АГС... снятие санкций произойдёт через некоторое время (в среднем несколько месяцев).

Неуникальные title у большого количества страниц.

спасибо, буду разбираться

Плюс, 31 страниц без всякого текста http://poolzar.ru/portfolio.html

Не представляющие ценности с точки зрения поискового робота. Вот их можно закрыть от индексации, а лучше - добавить текст.

Обычно закрывают все то, чего не нужно пускать в индекс.

Системные папки, папки со скриптами, админ-папка, профили пользователей (если есть), теги, результаты поиска.

Взгляните на свои папки на сервере - все ли там нужно пихать в Яндекс?