PHP. Средства разработки. В команде. Какие?

http://www.doophp.com/

Вырабатываете какую-то систему правил (можете поискать в интернете уже готовые). Например reg.ru выкладывали свою. Т.е. кто главный, как работаем с изменениями в бд и т.д.

Выбираете какую-то систему для ведения проекта. В ней будете писать новые задания, назначать их исполнителям, следить за статусом исполнения и т.д.

Выбираете систему контроля версий. Git например.

ТС, а на данный момент как организована работа, если не секрет?

Хочу ещё заметить лучше "вести" такую "систему" в обычном расшаренном Excel'e файле, но реально отражать все баги (фичи) и все реализации так чтобы через несколько месяцев было понятно что за бага была и как её чинили (как минимум что за бага, в чем её причина и какие файлы/методы были поправлены), чем использовать самую навороченную систему, но при этом или забывать записывать баги или писать типа "не работал модуль авторизации - пофиксил".

Zend. Так же наблюдается массовая миграция на Yii.

CVS/SVN системы контроля, вторая более удобная, имхо.

Никак. Пишется патч с инструкциями для базы, загоняется в движок сайта, сайт сам должен его подхватить и выполнить. Грубо говоря, должна быть реализована система апдейтов в движке.

Программисты сидят рядом - если да, то поможет кофе, печенье и шоколадки.

Багтрекер нужен простой, обычно что бы туда менеджерами и прочим составом вносились ошибки. Идеал, если эти ошибки можно вносить непосредственно с админки сайта, так сказать по горячим следам.