Склеит ли Яндекс домен и поддомен?

Вопрос задан неправильно.

Если контент один и тот же, то конечно же склеит.

А домен и поддомен это два разных сайта.

В терминах склеит/не склеит - да.

Однако, в выдаче как правило присутствует только один сайт - либо домен, либо поддомен. В этом смысле они, так сказать, "склеены" :)

Как правило в этом смысле и нужно :)

Ну вот, из таких топиков рождаются теории о склейке и неучёте ссылок. :D