Могут ли из-за склейки понизиться позиции?

Всем доброго времени суток!

В файле .htaccess у меня стоит редирект с сайта с www на сайт без него. Яндекс видел сайт без www

В какой-то момент заметил, что из индекса начали проподать страницы. А контент-то на сайте весь уникальный. Написал в поддержку яндекса и получил ответ:

В поисковой системе Яндекс сайты индексируются и участвуют в поиске только по адресу главного зеркала. Главным зеркалом Вашего сайта на данный момент является домен www.site.ru , но он отдает нашему роботу 301 перенаправление, и, соответственно, не может быть проиндексирован. Для того, чтобы сайт начал индексироваться по адресу текущего главного зеркала Вам нужно снять перенаправление.

Со временем робот сменит главное зеркало в соответствии с директивой Host.

Обратите внимание, что процесс переклейки зеркал полностью автоматизирован и в среднем может занимать до 4–6 недель, ускорить его, к сожалению, нельзя.

Вопросы:

1)Я правильно понимаю, что в этих трех строках:

RewriteEngine On

RewriteCond %{HTTP_HOST} ^www.site.ru$ [NC]

RewriteRule ^(.*)$ http://site.ru/$1 [R=301,L]

нужно убрать две нижние?

2)Надо ли делать что-то еще?

3)Может ли быть такое что-то из-за данной ситуации у сайта медленно росли позиции?