Дешевле 1 сайт по одну тематику или 3 тематики?

Очень многое зависит от вашего мастерсва внутренней(в данном случае уже локально внешней) оптимизации.

Еще все немного зависит от предполагаемых запросов и того: открыты ли домены уже или их только планируется делать... (в смысле транслита по яшкиному)

Еще чуть чуть зависит от того насколько разные запросы планируете двигать.

вообще совет: посмотрити десятки внимательно пару дней... там увидите примеры как неплохо живут "по России" с грамотым подоходом(свой регион это уж понятно)..

запрос 1 - недвижимость в Германии

запрос 2 - образование в Германии

домен есть 2ой, но пустой пока

при таком раскладе - кидайте на тот у которого история лучше

На всякий случай: если еще пачка НЧ идет в довесок, то их раскидайте на свой первый домен (если там хотя бы тиц есть уже а на втором судя по вашему описанию не должно быть). Раскидать - т.е по нутряку

возраст у доменов одинаковый, молодой и 1 уже в индексе и немного в топе

Просто не хочется все пихать на 1, потому что вдруг потом бан или еще чего, хотя весь контент уник и вообще сайт коммерческий, но с другой стороны поднимать разные сайты, тратя время и вдруг можно на ссылках сэкономить, не знаю короче..

Думаю логичней сделать два отдельных сайта. Припустим вы открываете заведение в котором в одном углу будут сидеть студенты, а в другом будет офис конторы по недвижимости.

Как по мне мясо и пирожное надо кушать отдельно, так легче будет пользователю перетравить.

Тогда однозначно лучше на субдомен сайт закачать, так как тематики практически идентичны. Нету смысла другой сайт создавать.