вопрос о переликовке

Если делаете перелинковку страниц 3 уровня кольцом, позаботьтесь о том, чтобы это было не одно кольцо, а 2-3. Это будет способствовать более равномерному распределению веса, в случае, если одна из страниц 3 уровня не будет проиндексирована (кольцо разорвано, если оно одно).

По поводу "не примут ли за навигации": зависит от реализации.

П.С. Это из теории, так сказать в лабораторных условиях...

насчет реализации... я описал как хочу сделать, пойдет так? или ваши предложения?

и как сделать не одно кольцо? котент это описание товара

вот ваш товар будут поисковики покупать?

Подумайте о людях, и они к вам потянуться

Предложите похожий товар в ссылках или сопутствующий, а не следующий и предыдущий

Как вы это зделаете это проблема движка

собираюсь организовать на джумле, позволит?

на джумле можно если есть знания в программирование, т.к. моделей я вроде не встречал. Если нет знаний то возьми лучше движок шопскрипт(http://www.shop-script.ru/) там есть такая функция по моему

Самый лучший вариант ответа на ваши вопросы могут дать поисковые системы. Посмотрите как это сделано у ваших конкурентов

С точки зрения sео. А Вы вообще какие страницы продвигаете? Если магазин - то логично продвигать внутренние по СЧ и НЧ, линковать их и ссылочный вес сливать на них. Зачем же тогда ссылаться на главную?

на главной планирую СЕО оптимизированный текст по двум основным ключевикам, для продвижения в топ по двум ВЧ, я думаю в правильном направлении?