Лучше одна большая MySQL или много маленьких?

по идее в одной базе попаданий в кеш при запросах будет больше, опять же по идее - будет быстрее, меньше строить дополнительных индексов , меньше опенфайлов, меньше сокетов используется.

ну при условии что ничего не блокируется кривыми запросами.

Лучше идти в сторону кэширования, так как в данном случае почти не будет запросов к базе.

А так по сути не столь важно, так как физически будет один сервер.

В общем случае кеш mysql лучше работает когда много маленьких баз, потому что достаточно обновить одну запись и из кеша вычищаются все запросы с данными из этой таблицы. Опять же параллизм выше даже если использовать myisam.

Другое дело что работать с кучей таблиц неудобно. Допустим вы захотите какую-нибудь глобальную статистику по всем сайтам рассчитать.

лучше когда для каждого сайта своя база - если бд одного из сайтов полетит то может накрыть всю базу

так таблиц или баз? все вышеприведенные рассуждения относятся к таблицам. если у вас в одной базе просто свалены таблицы с разным префиксами, то тут уже не так важно как хранить.

Именно так.