Joomla

Лично я прописываю код счетчиков в файле footer.php

а через админук нельзя?

Можно, через расширения->менеджер шаблонов->(выбираете ваш шаблон)->Редактор HTML файла шаблона. Я прописываю в самом низу.

madSEO, Можно вставить код счетчиков в модуль "Произвольный HTML-код" и назначить модулю отображение только на главной странице. Перед вставкой кода, в общих настройках сайта, отключите редакторы, иначе код может криво встать.

А через админку - создаете самописный модуль в позиции "footer", и в нем прописываете код счетчика

пишет, что запись запрещена, как это отключить?

создал модуль, но он не отображается на странице

А вы его публикацию включили?

И в шаблоне должно быть в месте, где должен быть счетчик, прописано

Может быть там написано так:

???

index.php is : Недоступен для записи

права по ftp выставьте... чего непонятного...