На что повлияет изменение структуры сайта

Обнаружил грубейшую ошибку на своем сайте (движок ДЛЕ)

Например, есть раздел site.ru/books/ (именно так стоит ссылка с морды), но при выводе новостей из этого раздела выводится ссылка на site.ru/main/books/. Соответственно внутренние страницы имеют вид site.ru/main/books/id-…html. Оба раздела абсолютно одинаковые, то есть получается дубль. Есть предположения, что именно за это на этот сайт наложен фильтр Яндексом «ты последний», но это уже другая тема…

Все это из-за неправильной структуры БД, так как категория books – это подкатегория категории main. А в идеале такого быть не должно.

Решил удалить со всех ссылок эту категорию main.

Вопрос: на что такое глобальное изменение структуры может повлиять? Упадут ли позиции. И как правильно это сделать? Я склоняюсь к 301-редиректу на всех таких внутренних страницах на страницы без main. Но как сделать такой редирект через htaccess.

То есть нужно все страницы вида

site.ru/main/category-1/…/category-n/id-..html

перенаправить на

site.ru/category-1/…/category-n/id-..html

Кто сможет помочь в решении таких вопросов.

P.S. Если запостил не туда, извиняюсь и прошу модераторов перенести тему.