Путаница с двумя доменами в Яndex - посоветуйте!

Это называется "зеркала". Со временем поисковики их "склеят" и будут выдавать только один из них. Как помочь с правильным выбором Яндексу, написано в его разделе помощи.

Дополнительно помочь можно изменив некоторые ссылки с относительны на абсолютные, и направить их на новый домен.

Для того, чтобы индексировалось выбранное вами зеркало, достаточно запретить индексацию всех остальных зеркал при помощи файла robots.txt. Это можно сделать, используя нестандартное расширение стандарта robots.txt — директиву Host, в качестве ее параметра указав имя основного зеркала. Если www.reklama.su — основное зеркало, то robots.txt должен выглядеть примерно так:

User-Agent: *

Disallow: /forum

Disallow: /cgi-bin

Host: www.reklama.su

В целях совместимости с роботами, которые не полностью следуют стандарту при обработке robots.txt, директиву Host необходимо добавлять в группе, начинающейся с записи User-Agent, непосредственно после записей Disallow.

http://www.ebanners.ru/viewtopic.php?t=63

Спасибо за ответы!

Буду пробовать.

Сталкивался с такой проблемой.

Прсто с помощью простенького скрипта поставил редирект со всех страниц зекрка на соответствующие страницы главного сайта. В течение месяца Яндекс разобрался что к чему. Редирект стоит до сих. Посетители не теряются, всё нормально индексится.