Нужно старый сайт оставить но его вес передать на новый

Если старый домен оброс естественными внешними ссылками, переезд на новый всегда приводит к потере "веса". Это аксиома, кто бы тут что ни балаболил. 

Для пользователя Вани который кликнул по ссылке разницы нет, ну кнопки стали круглее. А для поисковика это как если бы вы сменили паспорт, пол и гражданство, но оставили старую фамилию. Переиндексация будет полной и беспощадной

Это никак не получится. Так чтоб и старый оставить и весь вес на новый перенести. На ум приходит только если ссылки со старого на новый поставить. Но это ссылка, она передает только часть веса. 

Изначально старый сайт на поддомене? А на основном домене 2-го уровня что?

Лучше если вы полностью опишите архитектуру своего проекта.