include

Поисковикам неизвестно какими методами формировалась страница.

Результат работы скрипта - это обычный html код, без каких либо упоминаний о методах формирования.

Поэтому include никоим образом не может влиять на индексацию страниц.

Инклюд включает лишь содержимое. То что было и то что включено становятся нераздельным целым. Поисковик не отличит.

Да хоть парсите, только склеят :)