Не до конца отрабатывают php скрипты.

Размер отдаваемого html?

В браузер при этом html отдается?

Это какие-то большие списки?

размер не более 100 кб

html отдается до того места где прервалось выполнение скрипта

не списки, текст

Попробуйте включить все ошибки:

ini_set('display_errors', 'On'); // Это включит вывод ошибок в браузер
ini_set('error_reporting', E_ALL); // Это включит показ всех ошибок

Простое обновление страницы не решает проблему?

Ошибки включал. Ничего нет.

Обновление страницы ничего не дает. Прерывается на том же месте.

Но как я писал выше, как только добавляешь несколько пробелов или перевод строки в месте прерывания скрипта, то он отрабатывает полностью.

Приведу конкретный пример, Вот кусок кода футера:

<div class="d-md-flex justify-content-between align-items-center py-3 text-center text-md-left">
<div class="text-primary-hover"> Copyrights ©<?php echo date("Y"); ?> Все права защищены.</div>
<div class="mt-3 mt-md-0">

Код прерывался после знака копирайта.

Но когда я вставил перенос строки, то код стал выполняться дальше.

<div class="d-md-flex justify-content-between align-items-center py-3 text-center text-md-left">
<div class="text-primary-hover"> Copyrights ©
<?php echo date("Y"); ?> Все права защищены.</div>
<div class="mt-3 mt-md-0">

opcache / jit включены?

opcache включен

1.  Простите, а где здесь php? Ну кроме echo

Интересно получается. А не пробовали поменять версию php на любую другую (ну в пределах поддерживаемости Вашего кода) и посмотреть результат? Вдруг с модулем что-то странное...

Вопрос вообще о другом

У меня было что-то похожее. На одной системе код не выполнялся, когда шло вперемешку php и html. Не стал разбираться, а просто засунул весь html все в heredoc.