От перезагрузки блоков каждые 30 секунд смещается и трясется текст

Андрей, здравствуйте. Пришлите, пожалуйста, ваш логин, ID блоков и ссылку на страницу, на которой он размещён. Посмотрю, в чём может быть дело.

Из за этой штуки статьи на спортс.ру читать стало невозможно. Блоки исчезают и скрол прыгает. 

Так это у вас должен быть задан размер высоты контейнера, а внутри уже баннер.

Не задавание высоты контейнера считается вообще читом, например у гугла ) Многие вебмастера специально не задают высоту.

И при входе на главную человек пытается перейти по ссылкам на новость, а через 3 секунды вылезает реклама (контент смещается вниз) и он случайно нажимает не туда куда хотел, а на рекламный баннер.

Это от вебмастера зависит ) На лентеру был раньше дизайн, что при появлении рекламы контент сдвигался вниз через 2-3 сек. Поэтому из 100 попыток перехода на свежие новости я в трети случаев тыкал по рекламному баннеру.

Сделать правильную вёрстку.