Возможно ли с помощью ADBlock Plus заблокировать работу внутреннего скрипта на странице ?

Добавить можно свой фильтр на конкретный/ по маске js файл .

Ну это то я знаю.
Речь идет о вмешивании во внутренние скрипты, типа
<script>
...
...
</script>

Почитал что вроде можно, только не понял как.

там вроде как только функции можно блокировать:

https://github.com/dhowe/AdNauseam/wiki/Inline-script-tag-filtering