Позиции по определённым запросам выпадают полностью

Вы сами на вопрос ответили. Выдача от вашего сайта не зависит. Особенно в Яндексе.

И если страница была на 59 позиции, а стала на 61ю, то тоже вылетом считаете?

Это к разработчикам key collector вопрос, тут тоже:  1 = первое место , 60 = значит 6я страница 60-я позиция, -1 запроса нет в топ 60 (в настройках глубину парсинга можно настраивать).

Решений может быть много, зависит от вашего конкретного случая.

Вплоть до решения: бросить сайт и сделать новый.

снимайте онлайн сервисами лучше позиции

Смотрим выдачу: много морд, либо общая страница "Услуги".
Ключ - низкоконкурентный.
Что у вас не так - только анализом данных. Если у вас статейник, или плохо раскрыта семантика, или сайт технически очень кривой (викс какой-нибудь) - то я бы понял.
Но это всё вилами по воде.

Может и глюки Яндекса. А если проверить позиции сторонним сервисом? Вот здесь вроде бы годная подборка https://afftimes.com/seo/proverka-poziciy-v-poiskovikah/ (только обратите внимание - некоторые глючат по Гуглу или Яндексу. Внизу статьи есть сводная таблица, там все баги описаны).  А вообще надо смотреть по сайту в целом, одного скрина мало. 

У меня точно так же как у вас, только сайт информационный. Заметил что скачут только те запросы и страницы которые заточены под ВЧ или хорошие СЧ.

Хотел бы думать что это связано с тем что сайт молодой (моему только 6 месяцев) и яндекс пока не хочет давать траф по ВЧ запросам.

Мой сайт старый, держался в ТОП10 годами,  а последние пару недель начал выпадать полностью по выборочным запросам.

Такая же байда как и у Вас +- 20 позиций бывает  в течении нескольких дней . Узнавал у многих , но некоторые говорят  что конкуренты серьёзно крутят ПФ. И твой сайт по сравнению с ними по повед.факторам очень слабый и тебя выкидывает .  Скрин прикрепил нескольких позиций. раньше такого не было . Первый раз когда увидел думал под фильтр попал , стал по форумам бегать , пока бегал сайт востановился. Думаю всё продвижение скоро сойдет на накрутку ПФ. Я смотрю конкурентов которые возле меня у них посещаемость раз в 10-20 больше чем у меня . А мы возле находимся на одной грядке ))). Сомнения меня гложат ))

Ситуация 1 в 1. Вч и сч запросы по окнам. То 20-30 место, то 11 страница.