Могут комментарии просаживать запросы?

) ну если в комментах спам ссылки. то потенциально могут.

а если комменты от живых юзеров ( с матом)  . то в целом они на какие то позиции влияют 0,01%

Спама нет. Все модерируется.
Просто и в Google и в Яндекс начали проседать позиции на конкретной странице. При чем так прилично, с ТОП 1-3 до 14-15.
При этом никаких работ не проводилось. Единственные изменения - это новые комментарии.

Остальные страницы, которые были в ТОП 1, так и висят. То есть глобального фильтра/санкций нет.

Отключайте индекс у комментов и все

Это можно. Но с другой стороны, наличие живых индексируемых комментариев должно тоже давать бонус?

Или это ерунда?

Тут нет закономерности 

просели они сегодня ( причем у гугла и Яши) 

попробуйте удалить их для теста и посмотреть на одной из страниц

в 90% случаев комменты идут в плюс для позиций и трафика. Посмотрите по каким ключам просело и какие ключи в комментах , может комменты совсем не в тему или вида "супер, плюс"

Как тут сказали выше, в комментах могут так заспамить проект, что и легко под фильтр угодить. Я сортирую и добавляю комментарии в ручном режиме, дабы их  не так уж и много. 

У вас комменты с премодерацией? Количество текстах в комментах перебивает количество текста в описании? Проверьте текстовым анализатором, возможно у вас из-за комментов смысл страницы поменялся :) 

Киньте пример, чтоб понять