Ранжирование поддоменов

Здравствуйте. Есть гл. домен, ему присвоен регион Сочи и поддомены, также с присвоенными регионами Краснодар и РнД. Все было хорошо, гл. сайт и поддомены ранжировались, появились позиции траф. Но временами стали замечать резкое падение позиций в Яндексе. При анализе ранжируемых страницы (особенно по ВЧ), увидели, что в Сочи вместо основного домена стал ранжироваться краснодарский поддомен, в РнД тоже краснодарский и тд, какая то карусель. В чем может быть причина? Как показать Яндексу, что в Сочи должен быть главный домен, в Краснодаре поддомен и тд. 

Гл. домен и поддомены одинаковые по структуре и дизайну, но оптимизированы каждый под конкретный город