Внешние ссылки ведут на 404, плохо ли это?

Плохие ссылки - плохой результат. Типичная ситуация при переезде и смене структуры и url-ов.

В чем собственно проблема? Попробуйте сначала связаться с админами сайтов, на которых размещены ссылки на вас и вежливо попросите их обновить. Можно попробовать предложить оплатить эти операции (в пределах разумного). Если вас игнорят, то настройте редиректы. А вообще надо было сразу настроить автоматический редирект со старых урлов на чпу, чтобы не было 404.

Переезд на ЧПУ вам что-то дал?

Мысль понял.

Ссылки естественные - посты юзеров в форумах и блогах, так что просить администрацию отдельновзятого комьюнити редактировать сотню другую постов - проблематично, ровно как и писать юзерам оставившим эти ссылки (а это ещё и глупо).

переезд был вызван не этим, а моральным и техническим устареванием платформы, куча факторов вобщем. А ЧПУ решили сделать как бонус в любом случае урлы бы измениилсь, т.к. переезд контента осуществлялся вручную. Делать редирект тонны типовых урлов в ручную на новые с вложенностью категорий от 3 до 7 уровней глубиной это жесть.

Это очень плохо!!! Как можно скорее настройте редирект со старых УРЛов на новые. В таком случае вес и значимость ссылок с форумов\блогов через время (обычно 2 месяца) перейдет на новые страницы.