Table XXX is marked as crashed and should be repaired

Мне кажется, что не на части делить надо, а типы данных менять.

Небось у ТС таблица а-ля INT INT INT INT INT TIMESTAMP, т. е. 4 4 4 4 4 4 байта. А можно, например, INT SMALLINT INT TINYINT SMALLINT TIMESTAMP - уже будет ощутимый выигрыш. И ключей чего-то очень много - ИМХО некоторые лишние.