Дубль сайта попал в индекс

Ничего не будет. Вряд ли позиции просели от этого.

Было такое много раз, но никаких минусов от этого не было.

Лучше ботам ТП.

А разве позиции могут просесть из-за того, что не закрыли индексацию?

Если страниц дубля в индексе поисковика не осталось, то уже беспокоится не о чем.

Было такое года 3 назад. Разрабы сделали копию для своих переделок. Закрыли копию в роботс. Через, примерно, 8 мес увидел в выдаче карточку товара из тестового домена. Как оказалось на тестовый идет траф около 1к в мес и есть десяток необработанных заказов в админке. Сразу все закрыли паролем в htaccess.

Точно помню, что начал копать из-за просевших позиция в яндексе. Просадка была не сильная (3-5 позиций), но по всем каталогам. В последствии позиции вернулись.

100% уверенности, что просели именно из-за дубля сайта у меня нет.