Бан, не бан? Яша чудит не по детски

Так а показатели пф упали или возрасли после изменения движка + дизайна?

Сколько было/стало: просмотров на посетителя, время провождения на сайте, процент отказов, время загрузки страницы?

Это важные параметры, особенно, когда комментируют улучшать сайт - они явно по этим параметрам смотрят.

Да наверняка накосячили где-то в коде. Вам нужен технический аудит, только не от шарлотана какого-нибудь, а от нормального специалиста. Тут такие есть.

А вообще что касается движков - не трогайте боже упаси то, что хорошо работает, а для этого сайта 45к это ооочень хорошо. Дизайн можно было чуть подправить и без всяких переездов.

Может быть это связано с майскими праздниками?) Сравните посещалку с прошлым периодом (только Пасха была другого числа). Был обвал трафика?

Не грешите на Яшу. У вас была устоявшаяся ссылочная структура, со сменой движка эта структура исчезла. Сейчас Яша индексирует каждую вашу статью как новую, из-за этого весь сыр бор.