Вы не далеки от истины!☝
Естественная ссылка, это ссылка которая находится в естественном, соответствующем ей окружении, релевантном тексте и создана в момент публикации документа. 🚬
Все это пустое. Просто яша плавно переходит к учету только естественных ссылок. Платные еще учитываются, но на ранжирование влияют все меньше.
для того, что бы исправить ситуацию нужно сделать две вещи:
1. заставить бот заново проиндексировать сайт. для этого удаляете оба сайта из панели
(при этом удаление из панели не удаляет сайты из индекса). После этого заново добавляете сайты в панель с www и без. Соответственно заново подтверждаете права. В течении суток сайт будет переиндексирован.
2. После этого на обоих сайтах в панели управления указываете основной домен с www, а дальше только ждать. Как правило не больше двух недель.