Индексируются ли такие ссылки?

<a href="URL" onClick="someJavascriptfunction">

100% проиндексируется (у меня все меню такое)

Конечно индексируется. Не надо путать переход по JS-функции (не индексируется) и переход с одновременным выполнением какой -либо JS-функции (бот идет по ссылке, ссылка индексируется, а к выполнению скрипта бот индеферентен ;)).

У меня ссылки на яве в которых есть URL то есть не через jump и прочее, индексирует нормально, про Гугл и МСН вообще молчу там даже сложные скрипты читает (не всегда конечно, надо отдать им должное)

Может я за чем то не успел?

Разве может бот перейти по

<a href="javascript:document.location='bla-bla.html'">переход</a>?

Нет я наверное неправильно выразился имелось ввиду url такой <a href="http://" onClick="..."> это для Яндекса

А вот ссылки из такого типа каталога, где у меня были сайты: http://catalog.tut.by/click.phtml?id=**** я частенько встречал и в Гугле и в МСН, но для чистоты эксперимента скажу, что не на все ресурсы