Вирус в коде

KIS не панацея. И как это не банально, чем популярнее антивирусник, браузер и т.п., тем больше вероятность что-то словить.

Не пользуйтесь ФТП вообще. Он в принципе не безопасен, а уж тем более сохраняя пароли на компьютере :)

У нормальных хостеров есть SSH (scp sftp) и есть WinSCP - либо отдельная прога либо плагин к FAR

А ещё лучше, использовать безопасные Unix-like операционные системы, хотя бы для интернет-серфинга :)

хотя может и нет